基本信息:
姓名: 徐 丹
出生年月:1983.07 畢業(yè)院校: 第二軍醫(yī)大學(xué)
戶(hù)籍: 上海市 學(xué)歷: 博士
聯(lián)系電話:18801784186 專(zhuān)業(yè): 遺傳學(xué)
個(gè)人簡(jiǎn)介:
徐丹,博士,助理研究員。研究領(lǐng)域?yàn)橄滥[瘤表觀遺傳學(xué),主要從事肝再生、肝癌、肝干細(xì)胞和非編碼RNA 調(diào)控研究,熟悉肝再生、肝癌、肝干細(xì)胞研究領(lǐng)域的前沿和動(dòng)態(tài),掌握肝再生、肝癌、肝干細(xì)胞及非編碼RNA研究的各種技術(shù)和方法。迄今為止,在非編碼RNA 調(diào)控肝再生、肝癌機(jī)制的相關(guān)研究領(lǐng)域,已經(jīng)發(fā)表9 篇SCI 期刊論著,總影響因子80.571,主要論著發(fā)表在Hepatology、Carcinogenesis、Oncotarget及Biochim Biophys Acta 等期刊;其中,以第一作者身份在Hepatology 期刊(2013,2014,2018,IF=14.079)上發(fā)表論著3篇;在Oncotarget 期刊上發(fā)表論著1 篇。近五年來(lái),已負(fù)責(zé)承擔(dān)國(guó)家自然科學(xué)基金青年項(xiàng)目1 項(xiàng):長(zhǎng)鏈非編碼RNA-NR037844 在肝癌轉(zhuǎn)移過(guò)程中的功能及機(jī)制研究,國(guó)家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目1 項(xiàng):RNA 去甲基化酶FTO 介導(dǎo)的lncRNA-m6A 修飾對(duì)肝癌細(xì)胞代謝重編程的調(diào)控作用及機(jī)制研究,上海市自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目1 項(xiàng):長(zhǎng)鏈非編碼RNA-NR027250 在肝癌轉(zhuǎn)移過(guò)程中的功能及機(jī)制研究,上海市衛(wèi)計(jì)委青年項(xiàng)目1 項(xiàng):循環(huán)血液中長(zhǎng)鏈非編碼RNA在肝癌轉(zhuǎn)移中的預(yù)測(cè)應(yīng)用及其機(jī)制研究;此外,還獲得2016 年度同濟(jì)大學(xué)青年優(yōu)秀人才培養(yǎng)項(xiàng)目。在lncRNA 調(diào)控肝再生及肝癌的相關(guān)研究領(lǐng)域中,本人多次參加全國(guó)及上海市相關(guān)研究領(lǐng)域的學(xué)術(shù)會(huì)議,做大會(huì)報(bào)告,發(fā)表會(huì)議論文,并獲得優(yōu)秀論文獎(jiǎng)。
學(xué)習(xí)工作經(jīng)歷:
2002/09-2006/06,黑龍江大學(xué),生命科學(xué)學(xué)院,本科/學(xué)士
2006/09-2009/06,黑龍江大學(xué),生命科學(xué)學(xué)院,碩士研究生/碩士
2010/09-2013/06,第二軍醫(yī)大學(xué),基礎(chǔ)部醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)教研室,博士研究生/博士
2013/07-2015/12,上海交通大學(xué),醫(yī)學(xué)院附屬仁濟(jì)醫(yī)院上海市腫瘤研究所(癌基因及相關(guān)基因國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室),助理研究員
2016/01-至今,同濟(jì)大學(xué)附屬楊浦醫(yī)院/轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)中心,助理研究員
主持及參與課題情況:
1、國(guó)家自然基金面上項(xiàng)目,81874151,RNA 去甲基化酶FTO介導(dǎo)的lncRNA-m6A修飾對(duì)肝癌細(xì)胞代謝重編程的調(diào)控作用及機(jī)制研究,2019/01-2022/12,57萬(wàn),在研,主持。
2、國(guó)家自然基金青年項(xiàng)目,81402325、長(zhǎng)鏈非編碼RNA-NR037844在肝癌轉(zhuǎn)移過(guò)程中的功能及機(jī)制研究、2015/01-2017/12、23萬(wàn)元、結(jié)題、主持。
3、上海市衛(wèi)計(jì)委青年項(xiàng)目,20184Y0241,循環(huán)血液中長(zhǎng)鏈非編碼RNA在肝癌轉(zhuǎn)移中的預(yù)測(cè)應(yīng)用及其機(jī)制研究,2019/01-2021/12,10萬(wàn),在研,主持。
4、上海市自然科學(xué)基金項(xiàng)目,14ZR1439100、長(zhǎng)鏈非編碼RNA-NR027250在肝癌轉(zhuǎn)移過(guò)程中的功能及機(jī)制研究、2014/10-2017/10、10萬(wàn)元、結(jié)題、主持。
5、國(guó)家自然基金面上項(xiàng)目,81171937、肝再生過(guò)程中LncRNA 激活肝干細(xì)胞與肝癌發(fā)生的機(jī)制、2012/01-2015/12、50萬(wàn)元、結(jié)題、參與。負(fù)責(zé)內(nèi)容:主要負(fù)責(zé)關(guān)鍵LncRNA 的篩選和體內(nèi)體外功能研究
6、國(guó)家自然基金面上項(xiàng)目,81272280、DNA甲基化介導(dǎo)的miR-106a-363表達(dá)激活及其促結(jié)腸癌發(fā)生的作用與機(jī)制研究、2013/01-2016/12、70萬(wàn)元、結(jié)題、參與。負(fù)責(zé)內(nèi)容:主要負(fù)責(zé)靶基因篩選與功能驗(yàn)證
7、國(guó)家自然基金面上項(xiàng)目,81372240、胎肝特異性長(zhǎng)鏈非編碼RNA調(diào)控肝發(fā)育、肝干細(xì)胞分化和肝癌細(xì)胞上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化的表觀遺傳學(xué)機(jī)制研究、2014/01-2017/12、75萬(wàn)元、結(jié)題、參與。負(fù)責(zé)內(nèi)容:主要負(fù)責(zé)靶基因篩選與功能驗(yàn)證
8、國(guó)家自然基金面上項(xiàng)目,81874201,APC 通過(guò)泛素化調(diào)控凋亡的機(jī)制及其作為大腸癌化療療效標(biāo)志物的研究,2019/01-2022/12,53萬(wàn),在研,參加。
9、校級(jí)人才計(jì)劃-同濟(jì)大學(xué)青年優(yōu)秀人才培養(yǎng)行動(dòng)計(jì)劃,2017/01-2018/12、5萬(wàn)、在研、主持。
10、院內(nèi)課題,長(zhǎng)鏈非編碼RNA調(diào)控肝臟再生及肝癌復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移的功能及機(jī)制研究、2016/04-2018/04、3萬(wàn)、結(jié)題、主持。
11、院內(nèi)人才計(jì)劃-晨光計(jì)劃,2017/01-2019/12、4.7萬(wàn)、在研、主持。
參加學(xué)術(shù)會(huì)議:
2014 第八屆中國(guó)腫瘤學(xué)術(shù)大會(huì) 濟(jì)南 參加
2013 上海市醫(yī)學(xué)會(huì)醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)術(shù)年會(huì) 發(fā)表會(huì)議論文
2013 全國(guó)第十二次醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議鄭州 大會(huì)報(bào)告并獲優(yōu)秀論文獎(jiǎng)
2012 全國(guó)第十一次醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議武夷山 發(fā)表會(huì)議論文
2012 上海市醫(yī)學(xué)會(huì)醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)術(shù)年會(huì) 發(fā)表會(huì)議論文
代表性論文(#第一作者;*通訊作者)
1、期刊論文:
1. Dan Xu#, Fu Yang#, Ji-hang Yuan#, Ling Zhang, Hai-shan Bi, Chuan-chuan Zhou, Feng Liu, Fang Wang*, Shu-han Sun*. Long noncoding RNAs associated with liver regeneration 1 accelerates hepatocyte proliferation during liver regeneration by activating Wnt/β-Catenin signaling. Hepatology. Volume 58, Issue 2, Pages: 739–751, August 2013. (IF=14.079)
2. Jia De-shui#, Dong Rui#, Jing Ying#, Xu Dan#(co-first author), Wang Qi-feng, et al. Exome sequencing of hepatoblastoma reveals novel mutations and cancer genes in the Wnt pathway and ubiquitin ligase complex. Hepatology,Volume 60, Issue 5, pages 1686–1696, November 2014 (IF=14.079)
3. Dan Xu#, Ling Li#, Lin-sheng Wang, Xi Ma, Hong-meng Li,et al. Long noncoding RNA (lncRNA) down-regulated expression by HIF1α (DREH) inhibits hepatocellular carcinoma metastasis by silencing CDH2 expression. Accepted by Hepatologyon 10/31/2018. (IF=14.079)
4. Li Yan#, Xu Dan#(co-first author), Bao Chun-yang#, Zhang Yuan-nv, Chen Di, et al. MicroRNA-135b, a HSF1 target, promotes tumor invasion and metastasis by regulating RECK and EVI5 in hepatocellular carcinoma.Oncotarget, 6(4), 2421-2433, December 2014.(IF=5.168)
5. Fu Yang#, Ling Zhang#, Xi-song Huo, Ji-hang Yuan, Dan Xu, et al. Long noncoding RNA high expression in hepatocellular carcinoma facilitates tumor growth through enhancer of zeste homolog 2 in humans.Hepatology, 54(5):1679-1689, November 2011. (IF=14.079)
6. Ling Zhang#, Fu Yang#, Ji-hang Yuan#, Sheng-xian Yuan#, Wei-ping Zhou, Xi-song Huo,Dan Xu, et al. Epigenetic activation of the MiR-200 family contributes to H19-mediated metastasis suppression in hepatocellular carcinoma.Carcinogenesis2013 Mar;34(3):577-86 (IF=5.072)
7. Hai-shan Bi#, Xiang-yue Yang#, Ji-hang Yuan#, Fu Yang#, Dan Xu, et al. H19 inhibits RNA polymerase II-mediated transcription by disrupting the hnRNP U-actin complex. Biochim Biophys Acta, 1830(10):4899-4906, June 2013. (IF=3.679)
8. Hui-hong Jiang (#), Hua-guang Li (#), A-jian Li, Er-jiang Tang,Dan Xu, et al. Preoperative combined hemoglobin, albumin, lymphocyte and platelet levels predict survival in patients with locally advanced colorectal cancer. Oncotarget. 2016 Sep 27. doi: 10.18632/oncotarget. 12271. (IF=5.168)
9. Hui-hong Jiang (#), Er-jiang Tang, Dan Xu, Ying Chen, et al. Development and validation of nomograms for predicting survival in patients with non-metastatic colorectal cancer. Oncotarget. 2017 May 2;8(18):29857-29864. (IF=5.168)
10. Dan Xu, Da-wei Li, Chen-xi Zhao, Le-chen Li, Jun-jie Zhang, et al. ALKBH5-mediated m6A-Demethylation Activates lncRNA-MDAL Promotes Hepatocyte Proliferation and Glycometabolism by Pentose Phosphate Pathway. Under review by Science Translational Medicine. (Manuscript Number: aav1659)
2、會(huì)議論文:
1. Dan Xu, Fu Yang, Ji-hang Yuan, Ling Zhang, Hai-shan Bi, Chuan-chuan Zhou, Feng Liu, Fang Wang, Shu-han Sun*,Long Noncoding RNAs Associated With Liver Regeneration 1 Accelerates Hepatocyte Proliferation During Liver Regeneration by Activating Wnt/b-Catenin Signaling. 全國(guó)第十二次醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議論文集,2013.4.18-21,鄭州.大會(huì)報(bào)告并獲優(yōu)秀論文獎(jiǎng)。
2. 徐丹,楊富,袁繼行,畢海珊,張鈴、周傳傳、劉峰、王芳、孫樹(shù)漢*,LncRNA-LALR accelerates hepatocyte proliferation and cell cycle progression in liver regeneration by Wnt/β-Catenin signaling. 全國(guó)第十一次醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議論文集,2012.10.28-31,318頁(yè),武夷山,2012年。
3. Fang Wang, Dan Xu, Fu Yang, Ling Zhang, Xisong Huo, Jihang Yuan, Haishan Bi, Chuanhuan Zhou, Chunqi Gu, Ruiwen Chen, Shuhan Sun*, H19 promotes proliferation and Epithelial-Mesenchymal transition through a myc-related feedback loop during liver regeneration in mouse.2012年上海市醫(yī)學(xué)會(huì)醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)術(shù)年會(huì)會(huì)議論文集,2012.06.16,103-104頁(yè),上海,2012年。